Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
NCOA1Q15788 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NCOA1Q15788 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms