Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
BRD3Q15059 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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BRD3Q15059 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
BRD3Q15059 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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