Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
POLD3Q15054 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
POLD3Q15054 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
POLD3Q15054 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
POLD3Q15054 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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