Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NCAPHQ15003 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NCAPHQ15003 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms