Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NR1I3Q14994 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NR1I3Q14994 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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