Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
NFIXQ14938 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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