Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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CKAP5Q14008 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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CKAP5Q14008 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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CKAP5Q14008 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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CKAP5Q14008 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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CKAP5Q14008 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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CKAP5Q14008 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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CKAP5Q14008 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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CKAP5Q14008 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CKAP5Q14008 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CKAP5Q14008 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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