Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1CQ13936 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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