Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GTF2H2Q13888 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF2H2Q13888 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.5 ms