Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP1A4Q13733 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP1A4Q13733 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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