Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NAE1Q13564 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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