Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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ATRQ13535 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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ATRQ13535 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
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ATRQ13535 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
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ATRQ13535 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
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ATRQ13535 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
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ATRQ13535 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ATRQ13535 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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