Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SP140Q13342 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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SP140Q13342 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SP140Q13342 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
SP140Q13342 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SP140Q13342 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SP140Q13342 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SP140Q13342 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SP140Q13342 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SP140Q13342 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SP140Q13342 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SP140Q13342 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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SP140Q13342 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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SP140Q13342 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SP140Q13342 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SP140Q13342 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SP140Q13342 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SP140Q13342 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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SP140Q13342 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SP140Q13342 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SP140Q13342 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SP140Q13342 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SP140Q13342 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SP140Q13342 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SP140Q13342 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SP140Q13342 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SP140Q13342 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SP140Q13342 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SP140Q13342 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SP140Q13342 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SP140Q13342 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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SP140Q13342 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SP140Q13342 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SP140Q13342 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SP140Q13342 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SP140Q13342 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SP140Q13342 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SP140Q13342 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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