Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GRIN2BQ13224 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
GRIN2BQ13224 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms