Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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ERCC8Q13216 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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ERCC8Q13216 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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ERCC8Q13216 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
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ERCC8Q13216 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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ERCC8Q13216 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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ERCC8Q13216 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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ERCC8Q13216 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ERCC8Q13216 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ERCC8Q13216 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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