Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RESTQ13127 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RESTQ13127 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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RESTQ13127 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RESTQ13127 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RESTQ13127 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RESTQ13127 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RESTQ13127 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RESTQ13127 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RESTQ13127 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RESTQ13127 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RESTQ13127 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RESTQ13127 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RESTQ13127 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RESTQ13127 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RESTQ13127 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RESTQ13127 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RESTQ13127 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RESTQ13127 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RESTQ13127 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RESTQ13127 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RESTQ13127 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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