Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1AQ13111 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHAF1AQ13111 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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