Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MRPL28Q13084 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MRPL28Q13084 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
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