Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
STRN3Q13033 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.55□□□□□ -2
STRN3Q13033 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
STRN3Q13033 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.53□□□□□ -2
STRN3Q13033 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
STRN3Q13033 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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