Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
KIF5AQ12840 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KIF5AQ12840 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms