Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
EFEMP1Q12805 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
EFEMP1Q12805 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms