Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CHRNEQ04844 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms