Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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PGGT1BP53609 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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PGGT1BP53609 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PGGT1BP53609 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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PGGT1BP53609 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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PGGT1BP53609 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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PGGT1BP53609 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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PGGT1BP53609 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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PGGT1BP53609 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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PGGT1BP53609 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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PGGT1BP53609 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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PGGT1BP53609 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PGGT1BP53609 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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