Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
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PTPRCP08575 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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PTPRCP08575 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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PTPRCP08575 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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PTPRCP08575 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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PTPRCP08575 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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PTPRCP08575 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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PTPRCP08575 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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PTPRCP08575 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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PTPRCP08575 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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PTPRCP08575 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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PTPRCP08575 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTPRCP08575 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRCP08575 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRCP08575 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRCP08575 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRCP08575 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRCP08575 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRCP08575 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PTPRCP08575 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
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