Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CRXO43186 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CRXO43186 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CRXO43186 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CRXO43186 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CRXO43186 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CRXO43186 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CRXO43186 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CRXO43186 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CRXO43186 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CRXO43186 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CRXO43186 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CRXO43186 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CRXO43186 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CRXO43186 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CRXO43186 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CRXO43186 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CRXO43186 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CRXO43186 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CRXO43186 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CRXO43186 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CRXO43186 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CRXO43186 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CRXO43186 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CRXO43186 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CRXO43186 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CRXO43186 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CRXO43186 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CRXO43186 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CRXO43186 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CRXO43186 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CRXO43186 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CRXO43186 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CRXO43186 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CRXO43186 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CRXO43186 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CRXO43186 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.09□□□□□ -2.4
CRXO43186 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CRXO43186 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CRXO43186 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms