Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
J3KRW8 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
J3KRW8 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
J3KRW8 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
J3KRW8 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
J3KRW8 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
J3KRW8 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
J3KRW8 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
J3KRW8 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
J3KRW8 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
J3KRW8 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
J3KRW8 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
J3KRW8 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
J3KRW8 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
J3KRW8 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
J3KRW8 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
J3KRW8 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
J3KRW8 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
J3KRW8 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
J3KRW8 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
J3KRW8 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
J3KRW8 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
J3KRW8 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
J3KRW8 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
J3KRW8 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
J3KRW8 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
J3KRW8 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
J3KRW8 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
J3KRW8 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
J3KRW8 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
J3KRW8 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
J3KRW8 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
J3KRW8 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
J3KRW8 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
J3KRW8 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
J3KRW8 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
J3KRW8 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
J3KRW8 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
J3KRW8 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
J3KRW8 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
J3KRW8 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
J3KRW8 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
J3KRW8 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
J3KRW8 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
J3KRW8 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
J3KRW8 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
J3KRW8 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
J3KRW8 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
J3KRW8 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
J3KRW8 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
J3KRW8 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
J3KRW8 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
J3KRW8 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
J3KRW8 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
J3KRW8 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
J3KRW8 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
J3KRW8 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
J3KRW8 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
J3KRW8 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
J3KRW8 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
J3KRW8 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
J3KRW8 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
J3KRW8 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
J3KRW8 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
J3KRW8 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
J3KRW8 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.1 ms