Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USP35Q9P2H5 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP35Q9P2H5 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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