Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
TM7SF3Q9NS93 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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TM7SF3Q9NS93 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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TM7SF3Q9NS93 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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TM7SF3Q9NS93 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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TM7SF3Q9NS93 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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TM7SF3Q9NS93 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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TM7SF3Q9NS93 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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TM7SF3Q9NS93 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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TM7SF3Q9NS93 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TM7SF3Q9NS93 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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