Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CIPCQ9C0C6 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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