Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SMG1Q96Q15 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
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