Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.79□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
FAM3DQ96BQ1 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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FAM3DQ96BQ1 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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FAM3DQ96BQ1 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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FAM3DQ96BQ1 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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FAM3DQ96BQ1 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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FAM3DQ96BQ1 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
FAM3DQ96BQ1 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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