Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ANKRD39Q53RE8 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD39Q53RE8 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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