Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CLPPQ16740 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CLPPQ16740 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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