Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
ATP2B3Q16720 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ATP2B3Q16720 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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