Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CDKN3Q16667 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CDKN3Q16667 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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