Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
NREPQ16612 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
NREPQ16612 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NREPQ16612 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NREPQ16612 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NREPQ16612 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
NREPQ16612 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NREPQ16612 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NREPQ16612 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
NREPQ16612 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
NREPQ16612 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
NREPQ16612 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
NREPQ16612 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
NREPQ16612 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
NREPQ16612 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
NREPQ16612 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
NREPQ16612 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
NREPQ16612 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NREPQ16612 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NREPQ16612 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NREPQ16612 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NREPQ16612 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NREPQ16612 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NREPQ16612 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
NREPQ16612 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
NREPQ16612 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
NREPQ16612 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
NREPQ16612 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
NREPQ16612 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
NREPQ16612 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
NREPQ16612 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
NREPQ16612 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
NREPQ16612 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
NREPQ16612 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NREPQ16612 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NREPQ16612 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NREPQ16612 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NREPQ16612 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NREPQ16612 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
NREPQ16612 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NREPQ16612 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
NREPQ16612 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
NREPQ16612 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms