Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SNRNP35Q16560 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SNRNP35Q16560 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SNRNP35Q16560 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SNRNP35Q16560 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SNRNP35Q16560 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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