Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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SNCBQ16143 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
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SNCBQ16143 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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SNCBQ16143 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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SNCBQ16143 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
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SNCBQ16143 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
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SNCBQ16143 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNCBQ16143 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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