Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VAMP3Q15836 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
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