Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TTF1Q15361 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TTF1Q15361 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms