Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC-0.97□□□□□ -2.56
SMCO1Q147U7 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SMCO1Q147U7 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SMCO1Q147U7 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SMCO1Q147U7 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SMCO1Q147U7 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SMCO1Q147U7 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SMCO1Q147U7 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SMCO1Q147U7 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SMCO1Q147U7 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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