Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SQLEQ14534 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SQLEQ14534 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.8 ms