Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
COL9A3Q14050 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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