Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TNFAIP1Q13829 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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TNFAIP1Q13829 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNFAIP1Q13829 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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