Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CDH18Q13634 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CDH18Q13634 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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