Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
KRR1Q13601 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
KRR1Q13601 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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