| NAE1 | Q13564 | MIR4438-201 | ENST00000585271 | 93 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL096840.1-201 | ENST00000603287 | 93 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC005034.5-201 | ENST00000604219 | 466 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL360085.1-201 | ENST00000604713 | 532 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | 5S_rRNA.19-201 | ENST00000612131 | 110 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | 5S_rRNA.18-201 | ENST00000621941 | 110 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | C16orf97-206 | ENST00000622950 | 415 nt | TSL 2 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | U6.108-201 | ENST00000637764 | 58 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | GS1-279B7.1-204 | ENST00000641809 | 378 nt | BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | ATP11C-202 | ENST00000361648 | 6010 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | SLCO1B3-202 | ENST00000381545 | 2805 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZNF644-212 | ENST00000621077 | 2056 nt | TSL 5 BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | NEDD1-204 | ENST00000457368 | 3162 nt | TSL 2 BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-407P-201 | ENST00000365280 | 104 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC069023.1-201 | ENST00000442231 | 221 nt | TSL 3 BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC01399-202 | ENST00000458450 | 244 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | MRPS17P9-201 | ENST00000511924 | 393 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-436P-201 | ENST00000516171 | 114 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNY3P15-201 | ENST00000516297 | 97 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL035078.1-202 | ENST00000531627 | 413 nt | TSL 2 BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC092490.2-202 | ENST00000544922 | 462 nt | TSL 3 BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC084364.2-201 | ENST00000546924 | 395 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC116312.1-201 | ENST00000606841 | 314 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
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| NAE1 | Q13564 | FSD1L-201 | ENST00000374707 | 7062 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | XIRP2-201 | ENST00000295237 | 5246 nt | TSL 2 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | SI-201 | ENST00000264382 | 6011 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.26-201 | ENST00000362539 | 101 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD81.1-201 | ENST00000363064 | 77 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
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| NAE1 | Q13564 | SNORD113-8-201 | ENST00000363497 | 74 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-112P-201 | ENST00000363599 | 104 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.286-201 | ENST00000364813 | 102 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-806P-201 | ENST00000365147 | 105 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-21P-201 | ENST00000384710 | 107 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNA5SP323-201 | ENST00000391094 | 133 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-1186P-201 | ENST00000410429 | 97 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | EBAG9P1-201 | ENST00000418955 | 543 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC010409.1-201 | ENST00000487382 | 476 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC097501.2-201 | ENST00000502668 | 305 nt | TSL 5 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC097462.1-201 | ENST00000514125 | 324 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU1-142P-201 | ENST00000516682 | 145 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC009930.1-201 | ENST00000522330 | 191 nt | TSL 5 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC084882.1-201 | ENST00000561254 | 555 nt | TSL 4 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC008737.2-201 | ENST00000599446 | 118 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD113-5-201 | ENST00000607261 | 78 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | MGAT4C-207 | ENST00000552808 | 1937 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | PPP2R5A-205 | ENST00000537030 | 1719 nt | TSL 2 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | KTN1-207 | ENST00000438792 | 4449 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC010615.1-201 | ENST00000594254 | 1764 nt | BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | FSIP2-206 | ENST00000611759 | 3882 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | SAGE1-202 | ENST00000370709 | 2879 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.19-201 | ENST00000362462 | 99 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-324P-201 | ENST00000363957 | 106 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-296P-201 | ENST00000384608 | 107 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNA5SP212-201 | ENST00000391223 | 107 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU2-61P-201 | ENST00000411069 | 191 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC009310.1-201 | ENST00000414414 | 451 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC01701-201 | ENST00000419614 | 451 nt | TSL 2 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC069079.1-201 | ENST00000419889 | 400 nt | TSL 3 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | MTND5P22-201 | ENST00000458380 | 195 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RPS26P55-201 | ENST00000471178 | 356 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RPS26P45-201 | ENST00000471748 | 340 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL163195.1-201 | ENST00000496941 | 348 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | SEPT14P8-201 | ENST00000508026 | 178 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORA70.12-201 | ENST00000516084 | 153 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-1143P-201 | ENST00000516125 | 104 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU7-99P-201 | ENST00000516271 | 62 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC104819.3-201 | ENST00000603264 | 540 nt | TSL 4 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC010900.2-201 | ENST00000604508 | 210 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL161716.1-201 | ENST00000606365 | 273 nt | TSL 5 BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZNRD1-AS1_3.8-201 | ENST00000611686 | 104 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| NAE1 | Q13564 | TBL1XR1-208 | ENST00000430069 | 7948 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC092881.1-201 | ENST00000638218 | 2733 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.64-201 | ENST00000362845 | 102 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.162-201 | ENST00000363683 | 102 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORA63D-201 | ENST00000364359 | 132 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.329-201 | ENST00000365209 | 107 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | CLDN10-202 | ENST00000376855 | 701 nt | TSL 2 BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-505P-201 | ENST00000384427 | 107 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-102P-201 | ENST00000384485 | 104 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC019129.1-201 | ENST00000403786 | 261 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC244636.1-201 | ENST00000421152 | 228 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | MTATP8P1-201 | ENST00000467115 | 207 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | RPL23AP42-201 | ENST00000471152 | 471 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC098869.1-201 | ENST00000481627 | 292 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC093893.1-201 | ENST00000505781 | 510 nt | TSL 5 BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-496P-201 | ENST00000516145 | 99 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-327P-201 | ENST00000516270 | 127 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU7-172P-201 | ENST00000517125 | 64 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR4299-201 | ENST00000577899 | 72 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR3935-201 | ENST00000583472 | 104 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | CERS6-AS1-202 | ENST00000594898 | 499 nt | TSL 5 BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-117P-201 | ENST00000365415 | 107 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR520A-201 | ENST00000384862 | 85 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | TRAJ11-201 | ENST00000390526 | 60 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.581-201 | ENST00000391017 | 97 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |