Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NAE1Q13564 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NAE1Q13564 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms