Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
NEUROD1Q13562 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NEUROD1Q13562 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms