Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HDAC1Q13547 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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