Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ATRQ13535 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ATRQ13535 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ATRQ13535 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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